Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.081e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NBEAL2-201ENST00000416683 6364 ntTSL 1 (best)17.65■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NBEAL2-204ENST00000443829 3508 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.927e-11■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.777e-11■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.827e-11■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 EIF6-206ENST00000447927 932 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.747e-11■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 EIF6-205ENST00000440766 798 ntTSL 219.68■□□□□ 0.747e-11■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.657e-11■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CCDC28B-205ENST00000483009 615 ntTSL 518.83■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.24e-9■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.144e-9■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TBCE-205ENST00000472011 1840 ntTSL 215.82■□□□□ 0.124e-9■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.014e-9■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CUTA-206ENST00000465956 961 ntTSL 213.68□□□□□ -0.223e-12■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.575e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 MVD-209ENST00000565149 2352 ntTSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.925e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.185e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CCNG1-205ENST00000509143 562 ntTSL 24.56□□□□□ -1.687e-9■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.71e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.73e-9■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 DCAF15-204ENST00000588523 989 ntTSL 519.89■□□□□ 0.773e-9■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.212e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.92e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.632e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 UQCRC1-207ENST00000471189 955 ntTSL 316.05■□□□□ 0.161e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RNF126-207ENST00000605891 1671 ntTSL 536.45■■■■□ 3.429e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.129e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 39e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.469e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.449e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.349e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.189e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.139e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RALB-207ENST00000470417 1931 ntTSL 327.93■■■□□ 2.069e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.069e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.059e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.059e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PEMT-212ENST00000580147 708 ntTSL 327.78■■■□□ 2.049e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.919e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.99e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.81e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TBC1D20-203ENST00000461304 2024 ntTSL 1 (best)25.05■■□□□ 1.69e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.529e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.07■■□□□ 1.449e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TESMIN-202ENST00000432435 643 ntTSL 1 (best)23.45■■□□□ 1.349e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 MAP2K2-203ENST00000593364 872 ntTSL 523.44■■□□□ 1.349e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RNF126-202ENST00000586749 2092 ntTSL 223.22■■□□□ 1.319e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.32e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.272e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TTC19-206ENST00000475723 2591 ntTSL 222.78■■□□□ 1.249e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.239e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BAG6-250ENST00000451898 993 ntTSL 322.68■■□□□ 1.229e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.199e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.179e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.129e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.19e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RNF126-204ENST00000590885 1436 ntTSL 521.91■■□□□ 1.19e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.089e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FIBP-211ENST00000533037 1010 ntTSL 521.7■■□□□ 1.069e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FIBP-205ENST00000525765 608 ntTSL 521.69■■□□□ 1.069e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.049e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.029e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.973e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.969e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.959e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BAG6-248ENST00000441054 654 ntTSL 320.95■□□□□ 0.949e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.99e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.889e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.879e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BAG6-240ENST00000424480 1056 ntTSL 220.45■□□□□ 0.869e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.866e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.869e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.851e-8■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.839e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.839e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.821e-8■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.829e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.789e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.789e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.779e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FIBP-213ENST00000534032 982 ntTSL 219.82■□□□□ 0.769e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-8■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.746e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.739e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.719e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.44■□□□□ 0.79e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.74e-24■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.79e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 SIPA1-205ENST00000529725 435 ntTSL 219.28■□□□□ 0.689e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.672e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PEMT-211ENST00000490392 673 ntTSL 319.17■□□□□ 0.669e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.659e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.659e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.629e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PEMT-210ENST00000484838 803 ntTSL 218.89■□□□□ 0.619e-6■■■■□ 24.7
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