Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MAP3K1Q13233 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MAP3K1Q13233 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
MAP3K1Q13233 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
MAP3K1Q13233 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MAP3K1Q13233 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MAP3K1Q13233 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MAP3K1Q13233 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP3K1Q13233 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP3K1Q13233 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms