Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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