Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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