Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GRIK2Q13002 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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GRIK2Q13002 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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