Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TROQ12816 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TROQ12816 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
TROQ12816 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.69
TROQ12816 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TROQ12816 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TROQ12816 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TROQ12816 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TROQ12816 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TROQ12816 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TROQ12816 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TROQ12816 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TROQ12816 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TROQ12816 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TROQ12816 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TROQ12816 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TROQ12816 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TROQ12816 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TROQ12816 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TROQ12816 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROQ12816 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TROQ12816 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TROQ12816 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TROQ12816 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TROQ12816 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
TROQ12816 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TROQ12816 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TROQ12816 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TROQ12816 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROQ12816 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TROQ12816 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROQ12816 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
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