Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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