Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 SRO77YBL106C 3033 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 snR9snR9 187 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 DAD1YDR016C 285 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YDR018CYDR018C 1191 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 RSR1YGR152C 819 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 FYV4YHR059W 393 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 SDL1YIL167W 633 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 BUD19YJL188C 309 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 MRP49YKL167C 414 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 HSP10YOR020C 321 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 SCY1YGL083W 2415 nt2.33□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 SHE4YOR035C 2370 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 NPR3YHL023C 3441 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 TOF1YNL273W 3717 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YGR242WYGR242W 309 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YHR054CYHR054C 1065 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 AIM36YMR157C 768 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 RIO2YNL207W 1278 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YNR021WYNR021W 1215 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 JID1YPR061C 906 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 DAD3YBR233W-A 285 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 NAB3YPL190C 2409 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 TRZ1YKR079C 2517 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YDR338CYDR338C 2088 nt2.32□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 RLI1YDR091C 1827 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 PRP38YGR075C 729 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YGR226CYGR226C 210 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 RPL14BYHL001W 417 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YIL082WYIL082W 873 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YKL066WYKL066W 444 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 PAU23YLR037C 375 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 CSM4YPL200W 471 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 VID24YBR105C 1089 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 RPN3YER021W 1572 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YCL019WYCL019W 5313 nt2.31□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 SPF1YEL031W 3648 nt2.3□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YDL016CYDL016C 303 nt2.3□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YDL187CYDL187C 330 nt2.3□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 SCEIQ0160 708 nt2.3□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 PDP3YLR455W 915 nt2.3□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 ATP18YML081C-A 180 nt2.3□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YCK2YNL154C 1641 nt2.3□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 HAA1YPR008W 2085 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 VAC8YEL013W 1737 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 GAL80YML051W 1308 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YDR029WYDR029W 315 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 IRC2YDR112W 309 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YGL042CYGL042C 306 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YAL037WYAL037W 804 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 BNI1YNL271C 5862 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 TCB2YNL087W 3537 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YEL1YBL060W 2064 nt2.29□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 BCK1YJL095W 4437 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 GPI19YDR437W 423 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YMR31YFR049W 372 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 ERV1YGR029W 570 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 VMA21YGR105W 234 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 SWS2YNL081C 432 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YAP7YOL028C 738 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 MEI5YPL121C 669 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 RRG8YPR116W 834 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 UBP15YMR304W 3693 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 NEW1YPL226W 3591 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 KRE33YNL132W 3171 nt2.28□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 UBP16YPL072W 1500 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 ATP22YDR350C 2055 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 YBT1YLL048C 4986 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 APC11YDL008W 498 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 YGR228WYGR228W 345 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 PEX18YHR160C 852 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 CSE4YKL049C 690 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 ATG38YLR211C 681 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 RRT16YNL105W 429 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 YNL150WYNL150W 408 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 SWM2YNR004W 441 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 RCN2YOR220W 798 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 RBL2YOR265W 321 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 YPR172WYPR172W 603 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 ARR2YPR200C 393 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 MRD1YPR112C 2664 nt2.27□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 ALY1YKR021W 2748 nt2.26□□□□□ -2.05
HMS1Q12398 BFR1YOR198C 1413 nt2.26□□□□□ -2.05
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