Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 ATX1YNL259C 222 nt2.6□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.6□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 RSM19YNR037C 276 nt2.6□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 PHO80YOL001W 882 nt2.6□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 PDR1YGL013C 3207 nt2.6□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 BRE5YNR051C 1548 nt2.59□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 CPR5YDR304C 678 nt2.59□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 MVB12YGR206W 306 nt2.59□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.59□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 ACF4YJR083C 930 nt2.59□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 CSE4YKL049C 690 nt2.59□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 SYM1YLR251W 594 nt2.59□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 YLR252WYLR252W 306 nt2.59□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 SAS2YMR127C 1017 nt2.59□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 YNL324WYNL324W 396 nt2.59□□□□□ -1.99
HRT3Q12347 DUF1YOL087C 3351 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 SGS1YMR190C 4344 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 YDR061WYDR061W 1620 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 AIM11YER093C-A 414 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 GET1YGL020C 708 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 YGR039WYGR039W 312 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 RPL11BYGR085C 525 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 PSY1YKL076C 384 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 PDP3YLR455W 915 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 DYN3YMR299C 939 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 RSA1YPL193W 1146 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 RPL11AYPR102C 525 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 POL4YCR014C 1749 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 RIM13YMR154C 2184 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 NCS2YNL119W 1482 nt2.58□□□□□ -2
HRT3Q12347 VPS3YDR495C 3036 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 PEX6YNL329C 3093 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 ARF1YDL192W 546 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 YDR209CYDR209C 414 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 CHZ1YER030W 462 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 MIC19YFR011C 513 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 RPL16AYIL133C 600 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 PAU14YIL176C 363 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 PAU1YJL223C 363 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 ENV10YLR065C 546 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 CSI2YOL007C 1026 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 PFY1YOR122C 381 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 YOR169CYOR169C 465 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 YBR051WYBR051W 351 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 SKT5YBL061C 2091 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 SWC4YGR002C 1431 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 ADY4YLR227C 1482 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 ASM4YDL088C 1587 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 SHS1YDL225W 1656 nt2.57□□□□□ -2
HRT3Q12347 YBR259WYBR259W 2067 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 snR59snR59 78 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 RSM24YDR175C 960 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 YLR224WYLR224W 1110 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 TOM22YNL131W 459 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 YOL114CYOL114C 609 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 LTP1YPR073C 486 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 ARP8YOR141C 2646 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 AVT5YBL089W 1380 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 CWH41YGL027C 2502 nt2.56□□□□□ -2
HRT3Q12347 NUM1YDR150W 8247 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 SNA4YDL123W 423 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 TMA64YDR117C 1698 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 VPS74YDR372C 1038 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 RPL9AYGL147C 576 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 YIR020CYIR020C 303 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 MUB1YMR100W 1863 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 TOM70YNL121C 1854 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 STI1YOR027W 1770 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 GDS1YOR355W 1569 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 UBP16YPL072W 1500 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 SRP68YPL243W 1800 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 RPB5YBR154C 648 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 FLO11YIR019C 4104 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 KEL2YGR238C 2649 nt2.55□□□□□ -2
HRT3Q12347 CDC55YGL190C 1581 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 YDL050CYDL050C 372 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 YDR537CYDR537C 606 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 YFR054CYFR054C 579 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 COX13YGL191W 390 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 RSR1YGR152C 819 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 YHC1YLR298C 696 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 SEN15YMR059W 387 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 GPI15YNL038W 690 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 PRM3YPL192C 402 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 YBR062CYBR062C 543 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 SHE4YOR035C 2370 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 VIP1YLR410W 3441 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 EXO84YBR102C 2262 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 DIA2YOR080W 2199 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 PDR11YIL013C 4236 nt2.54□□□□□ -2
HRT3Q12347 SCP160YJL080C 3669 nt2.53□□□□□ -2
HRT3Q12347 KAR9YPL269W 1935 nt2.53□□□□□ -2
HRT3Q12347 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.53□□□□□ -2
HRT3Q12347 YDR157WYDR157W 402 nt2.53□□□□□ -2
HRT3Q12347 GIM4YEL003W 336 nt2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.8 ms