Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 ERB1YMR049C 2424 nt4.42□□□□□ -1.7
PUS1Q12211 FAS2YPL231W 5664 nt4.41□□□□□ -1.7
PUS1Q12211 YNL276CYNL276C 396 nt4.41□□□□□ -1.7
PUS1Q12211 SRL1YOR247W 633 nt4.41□□□□□ -1.7
PUS1Q12211 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt4.41□□□□□ -1.7
PUS1Q12211 YLL007CYLL007C 1998 nt4.41□□□□□ -1.7
PUS1Q12211 DHR2YKL078W 2208 nt4.41□□□□□ -1.7
PUS1Q12211 NIC96YFR002W 2520 nt4.4□□□□□ -1.7
PUS1Q12211 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.4□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.4□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.4□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.4□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.4□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.4□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.4□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 YKL069WYKL069W 543 nt4.4□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 YAL065CYAL065C 387 nt4.4□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 TAR1YLR154W-C 375 nt4.4□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.39□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.39□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 RPL6BYLR448W 531 nt4.39□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 KRE5YOR336W 4098 nt4.39□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 UBX5YDR330W 1503 nt4.39□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 YDR262WYDR262W 819 nt4.38□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 PHM6YDR281C 315 nt4.38□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 FRQ1YDR373W 573 nt4.38□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 SIP1YDR422C 2448 nt4.38□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 CWH43YCR017C 2862 nt4.38□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 RKM1YPL208W 1752 nt4.37□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 ECM25YJL201W 1800 nt4.37□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 snR62snR62 100 nt4.37□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 PSY1YKL076C 384 nt4.37□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 snR13snR13 124 nt4.37□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 YVC1YOR087W 2028 nt4.37□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 BYE1YKL005C 1785 nt4.37□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 EMC1YCL045C 2283 nt4.37□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 ABP140YOR239W 1887 nt4.37□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 MNR2YKL064W 2910 nt4.36□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 LRE1YCL051W 1752 nt4.36□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 POG1YIL122W 1056 nt4.36□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 NNF1YJR112W 606 nt4.36□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 VAM10YOR068C 345 nt4.36□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 YPL238CYPL238C 390 nt4.36□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 SEG1YMR086W 2883 nt4.36□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 YKL050CYKL050C 2769 nt4.36□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 DBF20YPR111W 1695 nt4.35□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 PAU2YEL049W 363 nt4.35□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 YNL010WYNL010W 726 nt4.35□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 YDL180WYDL180W 1644 nt4.35□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 EXO70YJL085W 1872 nt4.35□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 PDR12YPL058C 4536 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 VID27YNL212W 2349 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 RPO31YOR116C 4383 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 ARO80YDR421W 2853 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 BRE4YDL231C 3378 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 YNR065CYNR065C 3351 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 RPB2YOR151C 3675 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 RPL35AYDL191W 363 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 PSF1YDR013W 627 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 YLR076CYLR076C 423 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 IMD4YML056C 1575 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 PPZ1YML016C 2079 nt4.34□□□□□ -1.71
PUS1Q12211 MYO3YKL129C 3819 nt4.34□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 IOC2YLR095C 2439 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 RPC11YDR045C 333 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 YHL005CYHL005C 393 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 GEP4YHR100C 558 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 VPS55YJR044C 423 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 TIM8YJR135W-A 264 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 YKE2YLR200W 345 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 RPS7BYNL096C 573 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 LTP1YPR073C 486 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 HPR1YDR138W 2259 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 MLH2YLR035C 2088 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 RLM1YPL089C 2031 nt4.33□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 AGA1YNR044W 2178 nt4.32□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 OPI6YDL096C 327 nt4.32□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 YIL024CYIL024C 570 nt4.32□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 PET191YJR034W 327 nt4.32□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 PRE8YML092C 753 nt4.32□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 LSM7YNL147W 348 nt4.32□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 MON1YGL124C 1935 nt4.32□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 SRP72YPL210C 1923 nt4.32□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 ULP1YPL020C 1866 nt4.32□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 PTA1YAL043C 2358 nt4.31□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 RPS18AYDR450W 441 nt4.31□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 MFA1YDR461W 111 nt4.31□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 EMI1YDR512C 564 nt4.31□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 VEL1YGL258W 621 nt4.31□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.31□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt4.31□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt4.31□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 YOR050CYOR050C 348 nt4.31□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 BUD6YLR319C 2367 nt4.31□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 ATP25YMR098C 1839 nt4.3□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt4.3□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 OLI1Q0130 231 nt4.3□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 PAU14YIL176C 363 nt4.3□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 PAU1YJL223C 363 nt4.3□□□□□ -1.72
PUS1Q12211 VPS27YNR006W 1869 nt4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.9 ms