Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 CMC1YKL137W 336 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YLR224WYLR224W 1110 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 snR24snR24 89 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 BRE5YNR051C 1548 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.84□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt1.84□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt1.84□□□□□ -2.12
USB1Q12208 RGA2YDR379W 3030 nt1.84□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SIP3YNL257C 3690 nt1.84□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YBP2YGL060W 1926 nt1.83□□□□□ -2.12
USB1Q12208 MRPL32YCR003W 552 nt1.83□□□□□ -2.12
USB1Q12208 KEI1YDR367W 666 nt1.83□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt1.83□□□□□ -2.12
USB1Q12208 NTC20YBR188C 423 nt1.83□□□□□ -2.12
USB1Q12208 GPI17YDR434W 1605 nt1.83□□□□□ -2.12
USB1Q12208 ALK2YBL009W 2031 nt1.83□□□□□ -2.12
USB1Q12208 MAL33YBR297W 1407 nt1.83□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YPR089WYPR089W 2667 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 BUD26YDR241W 288 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 RPL27BYDR471W 411 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 AIM19YIL087C 474 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YJL032WYJL032W 315 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 RPF2YKR081C 1035 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 RPS22BYLR367W 393 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 MRPS8YMR158W 468 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 PEX27YOR193W 1131 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 PET20YPL159C 762 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SLM4YBR077C 489 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 NUR1YDL089W 1455 nt1.82□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YFR016CYFR016C 3702 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SNA4YDL123W 423 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 UBC13YDR092W 462 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 PIB1YDR313C 861 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YEA4YEL004W 1029 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 VAB2YEL005C 849 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YER091C-AYER091C-A 222 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 POL32YJR043C 1053 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 CSI2YOL007C 1026 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 GRE2YOL151W 1029 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YOL162WYOL162W 648 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SEC66YBR171W 621 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 VPS16YPL045W 2397 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YOR093CYOR093C 4947 nt1.81□□□□□ -2.12
USB1Q12208 ARP5YNL059C 2268 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SSP1YHR184W 1716 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 NOP14YDL148C 2433 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SRD1YCR018C 666 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SLD5YDR489W 885 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 GLC7YER133W 939 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 OST5YGL226C-A 261 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YKR051WYKR051W 1257 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 UBC12YLR306W 567 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 CCW14YLR390W-A 717 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SGT1YOR057W 1188 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 HAT1YPL001W 1125 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SHG1YBR258C 429 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 PRP6YBR055C 2700 nt1.8□□□□□ -2.12
USB1Q12208 UTP5YDR398W 1932 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SPP41YDR464W 4308 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 ADK1YDR226W 669 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 GPI19YDR437W 423 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 RPS17BYDR447C 411 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SVP26YHR181W 687 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 RFA3YJL173C 369 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 DGR1YNL130C-A 147 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YOR366WYOR366W 354 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 APA1YCL050C 966 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 ESA1YOR244W 1338 nt1.79□□□□□ -2.12
USB1Q12208 RTT101YJL047C 2529 nt1.78□□□□□ -2.12
USB1Q12208 NPR1YNL183C 2373 nt1.78□□□□□ -2.12
USB1Q12208 GEP7YGL057C 864 nt1.78□□□□□ -2.12
USB1Q12208 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.78□□□□□ -2.12
USB1Q12208 CTK2YJL006C 972 nt1.78□□□□□ -2.12
USB1Q12208 PUT3YKL015W 2940 nt1.78□□□□□ -2.12
USB1Q12208 SLS1YLR139C 1932 nt1.78□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YIL166CYIL166C 1629 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 SRB7YDR308C 423 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YPS5YGL259W 498 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YBL012CYBL012C 402 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 VTI1YMR197C 654 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RBL2YOR265W 321 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 CUR1YPR158W 759 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YCL023CYCL023C 348 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YJL070CYJL070C 2667 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 FAB1YFR019W 6837 nt1.77□□□□□ -2.13
USB1Q12208 BFR1YOR198C 1413 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 VPH1YOR270C 2523 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YCR090CYCR090C 549 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 BRP1YGL007W 378 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 CWC23YGL128C 852 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RRT16YNL105W 429 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 ATX1YNL259C 222 nt1.76□□□□□ -2.13
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