Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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