Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms