Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM1Q08AH1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACSM1Q08AH1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms