Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms