Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms