Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms