Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms