Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms