Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YPR170C	YPR170C	336 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	SGS1	YMR190C	4344 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	UTP15	YMR093W	1542 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	UBX3	YDL091C	1368 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	GIN4	YDR507C	3429 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	SRO77	YBL106C	3033 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	snR9	snR9	187 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	TMA20	YER007C-A	546 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	TCD1	YHR003C	1290 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YIR036W-A	YIR036W-A	402 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	COX8	YLR395C	237 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	CSM4	YPL200W	471 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	ALY1	YKR021W	2748 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	CWC22	YGR278W	1734 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YLR001C	YLR001C	2589 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	RGR1	YLR071C	3249 nt		2.87	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	PDR11	YIL013C	4236 nt		2.86	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YCR090C	YCR090C	549 nt		2.86	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	BAT1	YHR208W	1182 nt		2.86	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YJL086C	YJL086C	369 nt		2.86	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	MPP6	YNR024W	561 nt		2.86	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YAP7	YOL028C	738 nt		2.86	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	PIS1	YPR113W	663 nt		2.86	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	ESC1	YMR219W	4977 nt		2.85	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	VHR1	YIL056W	1923 nt		2.85	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	SEN54	YPL083C	1404 nt		2.85	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	HYP2	YEL034W	474 nt		2.85	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YMR254C	YMR254C	309 nt		2.85	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		2.85	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	MUD1	YBR119W	897 nt		2.85	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	MFB1	YDR219C	1398 nt		2.85	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	UTP14	YML093W	2700 nt		2.84	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YRR1	YOR162C	2433 nt		2.84	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YOL057W	YOL057W	2136 nt		2.84	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	VTC3	YPL019C	2508 nt		2.84	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YDR018C	YDR018C	1191 nt		2.84	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	FAR7	YFR008W	666 nt		2.84	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	VMA21	YGR105W	234 nt		2.84	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	CKA1	YIL035C	1119 nt		2.84	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	MES1	YGR264C	2256 nt		2.83	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	OCA6	YDR067C	675 nt		2.83	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YDR115W	YDR115W	318 nt		2.83	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YDR509W	YDR509W	348 nt		2.83	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YER107W-A	YER107W-A	321 nt		2.83	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YNL150W	YNL150W	408 nt		2.83	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	snR191	snR191	274 nt		2.83	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	NCS2	YNL119W	1482 nt		2.83	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	NEL1	YHR035W	1893 nt		2.82	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YJR087W	YJR087W	351 nt		2.82	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YAL037W	YAL037W	804 nt		2.82	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		2.82	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	MRP49	YKL167C	414 nt		2.82	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	ATP18	YML081C-A	180 nt		2.82	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		2.82	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	LOA1	YPR139C	903 nt		2.82	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	ERG28	YER044C	447 nt		2.81	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YLR224W	YLR224W	1110 nt		2.81	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.81	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	ACM1	YPL267W	630 nt		2.81	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	GEA1	YJR031C	4227 nt		2.81	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	OSW7	YFR039C	1533 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	snR59	snR59	78 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	NCB2	YDR397C	441 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	SLX9	YGR081C	633 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	LRP1	YHR081W	555 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YIL156W-B	YIL156W-B	222 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	PAU14	YIL176C	363 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	PAU1	YJL223C	363 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	ACF4	YJR083C	930 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	PSY1	YKL076C	384 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	GMC2	YLR445W	567 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	IRC21	YMR073C	606 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	POM152	YMR129W	4014 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	SLN1	YIL147C	3663 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	SGM1	YJR134C	2124 nt		2.8	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	SHE4	YOR035C	2370 nt		2.79	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	BFR1	YOR198C	1413 nt		2.79	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YEL057C	YEL057C	702 nt		2.79	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YJL119C	YJL119C	324 nt		2.79	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	BUD19	YJL188C	309 nt		2.79	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	PDP3	YLR455W	915 nt		2.79	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YPR014C	YPR014C	330 nt		2.79	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	TRM2	YKR056W	1920 nt		2.79	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	CTF13	YMR094W	1437 nt		2.78	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	TIM11	YDR322C-A	291 nt		2.78	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	RPS26B	YER131W	360 nt		2.78	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	EMC4	YGL231C	573 nt		2.78	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YGR228W	YGR228W	345 nt		2.78	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	SDL1	YIL167W	633 nt		2.78	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	SYS1	YJL004C	612 nt		2.78	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	MRPL33	YMR286W	261 nt		2.78	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	YOR169C	YOR169C	465 nt		2.78	□□□□□ -1.96
MRD1	Q06106	SCP160	YJL080C	3669 nt		2.78	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	PSD2	YGR170W	3417 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	SPB1	YCL054W	2526 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	SIP3	YNL257C	3690 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	TMN3	YER113C	2121 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	GAL80	YML051W	1308 nt		2.77	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms