Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms