Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms