Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms