Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ID3Q02535 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms