Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OC90Q02509 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OC90Q02509 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
OC90Q02509 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OC90Q02509 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OC90Q02509 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OC90Q02509 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OC90Q02509 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms