Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP4Q02446 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP4Q02446 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP4Q02446 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP4Q02446 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP4Q02446 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP4Q02446 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP4Q02446 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP4Q02446 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP4Q02446 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms