Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms