Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms