Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms