Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP5P82980 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP5P82980 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms