Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP1P78357 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms