Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms