Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms