Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK11-1P61568 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK11-1P61568 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms