Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms