Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPI1P60174 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TPI1P60174 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPI1P60174 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPI1P60174 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPI1P60174 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms