Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX3P56589 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX3P56589 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX3P56589 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX3P56589 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX3P56589 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX3P56589 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX3P56589 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX3P56589 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX3P56589 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX3P56589 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX3P56589 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX3P56589 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX3P56589 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX3P56589 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PEX3P56589 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PEX3P56589 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX3P56589 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX3P56589 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms