Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL23P55773 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL23P55773 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL23P55773 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL23P55773 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL23P55773 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL23P55773 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL23P55773 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms