Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARSP54136 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARSP54136 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARSP54136 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARSP54136 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARSP54136 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARSP54136 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARSP54136 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARSP54136 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARSP54136 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARSP54136 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARSP54136 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RARSP54136 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RARSP54136 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RARSP54136 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARSP54136 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARSP54136 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARSP54136 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms