Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPAP53621 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPAP53621 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPAP53621 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
COPAP53621 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPAP53621 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPAP53621 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms