Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK4P51957 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK4P51957 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK4P51957 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK4P51957 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK4P51957 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK4P51957 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK4P51957 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK4P51957 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK4P51957 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK4P51957 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK4P51957 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK4P51957 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms