Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLCN6P51797 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN6P51797 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms