Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RANGAP1P46060 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.5 ms