Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP5P45974 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP5P45974 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP5P45974 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP5P45974 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP5P45974 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP5P45974 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP5P45974 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP5P45974 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP5P45974 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP5P45974 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP5P45974 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP5P45974 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP5P45974 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms