Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD52P43351 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD52P43351 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAD52P43351 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD52P43351 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms