Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR1P43307 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR1P43307 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR1P43307 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR1P43307 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR1P43307 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR1P43307 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR1P43307 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms