Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFRP42898 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms