Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH1P40692 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH1P40692 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH1P40692 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH1P40692 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH1P40692 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH1P40692 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH1P40692 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH1P40692 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH1P40692 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH1P40692 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLH1P40692 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLH1P40692 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLH1P40692 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLH1P40692 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms