Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 SEC22YLR268W 645 nt3.36□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 UNG1YML021C 1080 nt3.36□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 LSM2YBL026W 288 nt3.36□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 NMA111YNL123W 2994 nt3.36□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 YPL039WYPL039W 951 nt3.36□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 YPL080CYPL080C 327 nt3.36□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 YPR197CYPR197C 564 nt3.36□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 CHS3YBR023C 3498 nt3.36□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 MIT1YEL007W 2001 nt3.36□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 YNR063WYNR063W 1824 nt3.35□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 RRM3YHR031C 2172 nt3.35□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 PSF1YDR013W 627 nt3.35□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 RRF1YHR038W 693 nt3.35□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 GIS2YNL255C 462 nt3.35□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 TIR2YOR010C 756 nt3.35□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 MYO5YMR109W 3660 nt3.35□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 SIZ1YDR409W 2715 nt3.35□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 YMR317WYMR317W 3423 nt3.34□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 MAK21YDR060W 3078 nt3.34□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 RPL29YFR032C-A 180 nt3.34□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 RNR4YGR180C 1038 nt3.34□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 YIL012WYIL012W 342 nt3.34□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 RPS21AYKR057W 264 nt3.34□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 TEN1YLR010C 483 nt3.34□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt3.34□□□□□ -1.87
SSZ1P38788 RNH70YGR276C 1662 nt3.33□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.33□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 AIP1YMR092C 1848 nt3.33□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 RPA135YPR010C 3612 nt3.33□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt3.33□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 TMA19YKL056C 504 nt3.33□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 FLD1YLR404W 858 nt3.33□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 BSC3YLR465C 309 nt3.33□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 TSC3YBR058C-A 243 nt3.33□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 BIT61YJL058C 1632 nt3.33□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 SLA1YBL007C 3735 nt3.32□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 STT4YLR305C 5703 nt3.32□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YSP2YDR326C 4317 nt3.32□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 TMA17YDL110C 453 nt3.32□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 RAD6YGL058W 519 nt3.32□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YGL165CYGL165C 579 nt3.32□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 RPS23AYGR118W 438 nt3.32□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 FRT2YAL028W 1587 nt3.32□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 MSR1YHR091C 1932 nt3.32□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 SPT10YJL127C 1923 nt3.32□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 KIN82YCR091W 2163 nt3.31□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 VTC4YJL012C 2166 nt3.31□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 CHA4YLR098C 1947 nt3.31□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 CWC22YGR278W 1734 nt3.31□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YDL242WYDL242W 354 nt3.31□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 PAU23YLR037C 375 nt3.31□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YNL146WYNL146W 303 nt3.31□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YPL197CYPL197C 414 nt3.31□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 IOC3YFR013W 2364 nt3.3□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 ARO1YDR127W 4767 nt3.3□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 RRT13YER066W 558 nt3.3□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 VOA1YGR106C 798 nt3.3□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YJR079WYJR079W 330 nt3.3□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 VPS3YDR495C 3036 nt3.3□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 TFB1YDR311W 1929 nt3.29□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 RPS20YHL015W 366 nt3.29□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 SIP18YMR175W 240 nt3.29□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 ENA5YDR038C 3276 nt3.29□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 BFR1YOR198C 1413 nt3.28□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YDR090CYDR090C 933 nt3.28□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 LAG1YHL003C 1236 nt3.28□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt3.28□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 DGK1YOR311C 873 nt3.28□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 YPL185WYPL185W 396 nt3.28□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 STU2YLR045C 2667 nt3.28□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 TRZ1YKR079C 2517 nt3.28□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 BCH1YMR237W 2175 nt3.28□□□□□ -1.88
SSZ1P38788 DYN2YDR424C 279 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 TIF35YDR429C 825 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 SDH7YDR511W 402 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 UTP11YKL099C 753 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 RNP1YLL046C 750 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 RPL37AYLR185W 267 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 PEX17YNL214W 600 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 TIM12YBR091C 330 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YSY6YBR162W-A 198 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 SWD3YBR175W 948 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 VHR2YER064C 1518 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 GPI13YLL031C 3054 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 SNF12YNR023W 1701 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 ROY1YMR258C 1662 nt3.27□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 CSR2YPR030W 3366 nt3.26□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 COX23YHR116W 456 nt3.26□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 ZEO1YOL109W 342 nt3.26□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 MDV1YJL112W 2145 nt3.26□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 CCT7YJL111W 1653 nt3.26□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 FLO5YHR211W 3228 nt3.26□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 SNQ2YDR011W 4506 nt3.26□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 NOP4YPL043W 2058 nt3.26□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 RAD5YLR032W 3510 nt3.26□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 ROM1YGR070W 3468 nt3.25□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 DPB11YJL090C 2295 nt3.25□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 IRC4YDR540C 540 nt3.25□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 ERG28YER044C 447 nt3.25□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.25□□□□□ -1.89
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