Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms